Ministro kuruojami padaliniai ir pavaldžios įstaigos

Ministro patarėjai;
Viešosios politikos sprendimų ir duomenų analizės grupė;
Centralizuoto vidaus audito tarnyba;
Projektų valdymo skyrius;
Vidaus kontrolės įgyvendinimo skyrius;
Ryšių su visuomene skyrius, kuris atskaitingas ministro patarėjui Karoliui Vaitkevičiui; 
Komercijos, ekonomikos ir inovacijų, ekonomikos ir vidaus rinkos atašė;
Prekybos atstovas Lietuvos Respublikos prekybos atstovybėje Taipėjuje;
Ekonomikos ir inovacijų ministerijos vyriausiais patarėjas (parengties pareigūnas);
Ekonomikos ir inovacijų ministerijos vyriausieji patarėjai.